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张迪

邮  箱: zhangdi@pku.edu.cn

职  称:研究员

办公室电话:62750437

办公室地址:北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,金光生命科学大楼,100871

实验室电话:62750430

实验室地址:北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,金光生命科学大楼,100871

实验室主页:http://di-zhang-lab.com

个人主页:https://scholar.google.com/citations?user=vU5Sz28AAAAJ&hl=en

  • 个人简介
  • 科研领域
  • 代表性论文

个人介绍:

2013年毕业于北京大学基础医学院八年制,获生物化学及分子生物学博士学位,师从尚永丰院士,从事基因转录调控与肿瘤分子生物学研究。2013-2020年在芝加哥大学Ben May Department for Cancer Research开展博士后及Research professional研究工作,师从赵英明教授用高分辨质谱技术研究蛋白质修饰,首次发现了哺乳动物细胞内包括乳酸来源和酮体来源在内的多种新型组蛋白修饰。2021年3月正式加入北京大学生命科学学院和北大-清华生命科学联合中心,担任研究员.

教育经历:

2010 - 2013,理学博士,生物化学与分子生物学,北京大学
2005 - 2010,医学学士,基础医学,北京大学

荣誉奖励:

工作经历:

2021.3 - 今,研究员,北大清华生命科学联合中心
2021.3 - 今,研究员,北京大学生命科学学院
2013.9 - 2021.1,博士后,美国芝加哥大学 Ben May Department for Cancer Research

执教课程:

分子生物学,本科生
      张迪实验室致力于研究细胞代谢对染色质活动的调控新机制,以及异常在肿瘤、自身免疫病、认知障碍、衰老等生理和疾病中的作用。在该领域的贡献包括:首次鉴定出乳酸来源的新型组蛋白修饰——赖氨酸乳酰化修饰;首次鉴定出酮体来源的新型组蛋白修饰——赖氨酸 beta-羟基丁酰化修饰。这些代谢物来源的新型组蛋白修饰的功能在于整合细胞代谢状态并调节基因转录以帮助细胞适应内外环境信号的刺激和变化。近五年来在Nature, Nature Genetics, Molecular Cell, Science Advances, Nature Communications, Nature Reviews Molecular Cell Biology等杂志发表多篇文章。
*Equal contribution.
1. Moreno-Yruela C, Zhang D*, Wei W, Bæk M, Liu W, Gao J, Danková D, Nielsen AL, Bolding JE, Yang L, Jameson ST, Wong J, Olsen CA, Zhao Y. Class I histone deacetylases (HDAC1-3) are histone lysine delactylases. Sci Adv. 2022 Jan 21;8(3):eabi6696. doi: 10.1126/sciadv.abi6696. Epub 2022 Jan 19. PMID: 35044827; PMCID: PMC8769552.

2. Huang H, Zhang D*, Weng Y, Delaney K, Tang Z, Yan C, Qi S, Peng C, Cole PA, Roeder RG, Zhao Y (2021). The regulatory enzymes and protein substrates for the lysine β-hydroxybutyrylation pathway. Sci Adv. 7(9): eabe2771.

3. Zhang D*, Tang Z*, Huang H, Zhou G, Cui C, Weng Y, Liu W, Kim S, Lee S, Perez-Neut M, Czyz D, Hu R, Ye Z, He M, Zheng YG, Shuman H, Ding J, Dai L, Ren B, Robert RG, Becker L, Zhao Y. (2019) Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature. 574: 575-580.

Highlighted by
Nature news & views: https://www.nature.com/articles/d41586-019-03122-1
Science Signaling Editor’s choice: https://stke.sciencemag.org/content/12/606/eaba0502.full
Nature Immunology Research Highlight: https://www.nature.com/articles/s41590-019-0551-6
Trends in Biochemical Sciences Spotlight:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0968000419302658
Immunity Preview: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1074761319304893
Cited by
Nature reviews Cancer, Nature reviews immunology, Nature reviews Genetics, Nature reviews Microbiology, Nature reviews Endocrinology, Trends in biochemical Sciences, Trends in Cell Biology, Trends in Immunology

4. Huang H, Zhang D, Wang Y, Perez-Neut M, Han Z, Zheng YG, Hao Q, Zhao Y. (2018). Lysine benzoylation is a histone mark regulated by SIRT2. Nat Commun. 9(1):3374.

5. Sabari BR*, Zhang D*, Allis CD, Zhao Y. (2017). Metabolic Regulation of Gene Expression through Differential Histone Acylation. Nat Rev Mol Cell Biol. 18(2):90-101.

6. Xie Z*, Zhang D*, Chung D*, Tang Z, Huang H, Dai L, Qi S, Li J, Colak G, Chen Y, Xia C, Peng C, Ruan H, Kirkey M, Wang D, Jensen LM, Kwon OK, Lee S, Pletcher SD, Tan M, Lombard DB, White KP, Zhao H, Li J, Roeder RG, Yang X, Zhao Y. (2016). Metabolic Regulation of Gene Expression by Histone Lysine beta-hydroxybutyrylation. Mol Cell. 62 (2):194-206.

7. Goudarzi A*, Zhang D*, Huang H, Barral S, Kwon OK, Qi S, Tang Z, Buchou T, Vitte AL, He T, Cheng Z, Montellier E, Gaucher J, Curtet S, Debernardi A, Charbonnier G, Puthier D, Petosa C, Panne D, Rousseaux S, Roeder RG, Zhao Y‡, Khochbin S‡. (2016). Dynamic Competing Histone H4 K5K8 Acetylation and Butyrylation Are Hallmarks of Highly Active Gene Promoters. Mol Cell. 62(2): 169-80.

8. Zhang Y*, Zhang D*, Liang J, Yi X, Gui B, Yu W, Sun L, Yang X, Han X, Chen Z, Liu S, Si W, Yan R, Wang Y, Shang Y‡. (2016). Nucleation of DNA Repair Factors by FOXA1 Links DNA Demethylation to Transcriptional Pioneering. Nat Genet. 48 (9):1003-13.

9. Li L, Shi L, Yang S, Yan R, Zhang D, Yang J, He L, Li W, Yi X, Sun L, Liang J, Cheng Z, Shi L, Yu W, Shang Y‡. (2016). SIRT7 Is a Histone Desuccinylase that Functionally Links to Chromatin Compaction and Genome Stability. Nat Commun. 7:12235.

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