内网

检测到您当前使用浏览器版本过于老旧,会导致无法正常浏览网站;请您使用电脑里的其他浏览器如:360、QQ、搜狗浏览器的极速模式浏览,或者使用谷歌、火狐等浏览器。

下载Firefox
张迪

邮  箱: zhangdi@pku.edu.cn

职  称:研究员

实验室地址:北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,金光生命科学大楼,100871

个人主页:https://scholar.google.com/citations?user=vU5Sz28AAAAJ&hl=en

  • 个人简介
  • 科研领域
  • 代表性论文

个人介绍:

2013年毕业于北京大学基础医学院八年制,获生物化学及分子生物学博士学位,师从尚永丰院士,从事基因转录调控与肿瘤分子生物学研究。2013-2020年在芝加哥大学Ben May Department for Cancer Research开展博士后及Research professional研究工作,师从赵英明教授用高分辨质谱技术研究蛋白质修饰,首次发现了哺乳动物细胞内包括乳酸来源和酮体来源在内的多种新型组蛋白修饰。2021年3月正式加入北京大学生命科学学院和北大-清华生命科学联合中心,担任研究员.

教育经历:

2010 - 2013,理学博士,生物化学与分子生物学,北京大学
2005 - 2010,医学学士,基础医学,北京大学

工作经历:

2021.3 - 今,研究员,北大清华生命科学联合中心
2021.3 - 今,研究员,北京大学生命科学学院
2013.9 - 2021.1,博士后,美国芝加哥大学 Ben May Department for Cancer Research
      组蛋白修饰作为复杂的基因表达调控网络中的一环,在从建立正常的发育过程到因为异常而导致的各种人类疾病中均具有重要作用。令人感到惊奇的是,催化和调节各种组蛋白修饰的酶均需要细胞中间代谢产物作为辅酶,这提示细胞代谢和组蛋白修饰这两条通路间存在着紧密联系。然而,除了乙酰化和甲基化等少数几种组蛋白经典修饰外,细胞中是否存在来源于其他中间代谢产物的组蛋白修饰类型尚属未知领域。而代谢小分子在细胞核中如何参与基因的表达调控这个更广泛而重要的议题则少有人问津。
      本实验室致力于探索细胞代谢对蛋白质修饰、活性及功能的影响,尤其关注代谢对染色质生物学调控新机制的发现以及相关调控通路在发育,衰老,肿瘤,免疫等生理及病理过程中的生物学功能。我们运用表观遗传学、分子生物学、以及转录组,蛋白质组等多组学手段,研究方向主要包括:
  1. 新型蛋白质修饰的发现,鉴定及功能研究。
  2. 经典细胞代谢关键酶在细胞核中的新功能研究。
  3. 代谢小分子对基因转录调控的分子机制及功能研究。
*Equal contribution.
1. Huang H, Zhang D*, Weng Y, Delaney K, Tang Z, Yan C, Qi S, Peng C, Cole PA, Roeder RG, Zhao Y (2021). The regulatory enzymes and protein substrates for the lysine β-hydroxybutyrylation pathway. Sci Adv. 7(9): eabe2771.

2. Zhang D*, Tang Z*, Huang H, Zhou G, Cui C, Weng Y, Liu W, Kim S, Lee S, Perez-Neut M, Czyz D, Hu R, Ye Z, He M, Zheng YG, Shuman H, Ding J, Dai L, Ren B, Robert RG, Becker L, Zhao Y. (2019) Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature. 574: 575-580.

Highlighted by
Nature news & views: https://www.nature.com/articles/d41586-019-03122-1
Science Signaling Editor’s choice: https://stke.sciencemag.org/content/12/606/eaba0502.full
Nature Immunology Research Highlight: https://www.nature.com/articles/s41590-019-0551-6
Trends in Biochemical Sciences Spotlight:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0968000419302658
Immunity Preview: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1074761319304893
Cited by
Nature reviews Cancer, Nature reviews immunology, Nature reviews Genetics, Nature reviews Microbiology, Nature reviews Endocrinology, Trends in biochemical Sciences, Trends in Cell Biology, Trends in Immunology

3. Huang H, Zhang D, Wang Y, Perez-Neut M, Han Z, Zheng YG, Hao Q, Zhao Y. (2018). Lysine benzoylation is a histone mark regulated by SIRT2. Nat Commun. 9(1):3374.

4. Sabari BR*, Zhang D*, Allis CD, Zhao Y. (2017). Metabolic Regulation of Gene Expression through Differential Histone Acylation. Nat Rev Mol Cell Biol. 18(2):90-101.

5. Xie Z*, Zhang D*, Chung D*, Tang Z, Huang H, Dai L, Qi S, Li J, Colak G, Chen Y, Xia C, Peng C, Ruan H, Kirkey M, Wang D, Jensen LM, Kwon OK, Lee S, Pletcher SD, Tan M, Lombard DB, White KP, Zhao H, Li J, Roeder RG, Yang X, Zhao Y. (2016). Metabolic Regulation of Gene Expression by Histone Lysine beta-hydroxybutyrylation. Mol Cell. 62 (2):194-206.

6. Goudarzi A*, Zhang D*, Huang H, Barral S, Kwon OK, Qi S, Tang Z, Buchou T, Vitte AL, He T, Cheng Z, Montellier E, Gaucher J, Curtet S, Debernardi A, Charbonnier G, Puthier D, Petosa C, Panne D, Rousseaux S, Roeder RG, Zhao Y‡, Khochbin S‡. (2016). Dynamic Competing Histone H4 K5K8 Acetylation and Butyrylation Are Hallmarks of Highly Active Gene Promoters. Mol Cell. 62(2): 169-80.

7. Zhang Y*, Zhang D*, Liang J, Yi X, Gui B, Yu W, Sun L, Yang X, Han X, Chen Z, Liu S, Si W, Yan R, Wang Y, Shang Y‡. (2016). Nucleation of DNA Repair Factors by FOXA1 Links DNA Demethylation to Transcriptional Pioneering. Nat Genet. 48 (9):1003-13.

8. Li L, Shi L, Yang S, Yan R, Zhang D, Yang J, He L, Li W, Yi X, Sun L, Liang J, Cheng Z, Shi L, Yu W, Shang Y‡. (2016). SIRT7 Is a Histone Desuccinylase that Functionally Links to Chromatin Compaction and Genome Stability. Nat Commun. 7:12235.

检测到您当前使用浏览器版本过于老旧,会导致无法正常浏览网站;请您使用电脑里的其他浏览器如:360、QQ、搜狗浏览器的极速模式浏览,或者使用谷歌、火狐等浏览器。

下载Firefox